Nature Coding

  

いつか恐竜のDNAが解読され、全ゲノムが判明する日が来るに違いない、と思っていた。
化石からDNAを抽出して恐竜を現代に蘇らせる。
これがSF小説ジュラシックパークの本質の一つだ。
現在のゲノム解析スピードをメーカーのカタログから引用すると…

　　　2012年の現在、
　　　１回の測定で5人のヒト全ゲノム解析を11日間で。費用は70万円。
　　　これが2003年のヒトゲノムプロジェクトの時点では、
　　　一人の全データの産出に10年、さらに解析に3年。費用は3000億円。

なお、前者の費用には機械のお値段は入っていない。
（この手の機械って、たぶん一台数億円レベル？）
でも人件費を比較すると、桁の違いはそんなに外れていないだろう。
それだけ機械の並列処理の効率が上がったということである。
（機械一台で処理できる並列数、10年前は96のところが、現在は億単位）
コンピューターの性能向上により、短く分断されたDNAの解析能力が
飛躍的に高まったことも技術背景にあるようだ。
恐竜のDNAのさえ入手できれば、個人でも解析できそうである。
恐竜のように全く未知のデータ解析は、11日では終わらないだろう。
でも月単位の時間で解析は行われうると期待される。
あとは保存状態の良い化石をいかに見つけるか、
そこからDNAをいかに取り出すか、という技術ハードルを超えるだけだ。

そんな妄想の可能性を試算するようなニュース（Nature誌）が入ってきた。

　　　保存状態のよい化石のDNAの半減期を試算したところ、
　　　DNAが解読できる限界は150万年。

　　　ネタ元の原著：
　　　　Allentoft, M. E. et al. Proc. R. Soc. B　 (2012).

恐竜が絶滅したとされる年代は6500万年前。・・・全然とどかない。
でも記事によると、現在解読できている最古の記録は50万年前までだそうで、
今回の試算はその最長記録を破る可能性を示している、と評されている。
最後にこの研究者は、
　　　「永久凍土や洞窟といった保存状態の良い場所で、
　　　　実際にこの試算が再現されるか調べてみたい」
とも書いている。
思いもよらない土壌の物理化学的性質によって限界時間が伸びた、
なんてことがないかなあ。




博物館の夜

K-5　　DA18-135mmF3.5-5.6ED AL[IF] DC WR

写真は琵琶湖博物館。
こんな図書室が近くにあったらいいなあ。
ナイトミュージアム観覧中の一枚。

湖底のような環境も埋没したものが長期保存される。
遺跡や大戦中の戦闘機なども調査されているようだ。